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响应“精准医疗” FDA要建立基因大数据共享平台!

发表日期:2015-08-10
随着奥巴马政府精准医学计划的提出,个性化诊断、基因测序等概念又一次变得炙手可热。然而,随着技术的日趋成熟,众多检测方法对FDA提出了尽快适应形势的要求。为了与精准医学计划相呼应,FDA计划建立一个名为“精准FDA”(precisionFDA)平台。最近,著名的生物信息学公司DNAnexus公司与FDA签订了第一份合作协议,可被看做是向前迈出了重要一步。尽管这次协议涉及的金额可以说是少的可怜,仅为85万美元,但是合约双方都认为这是十分重要的一步。
 
  DNAnexus将要打造的这个名为“精准FDA”的平台是一个为研究人员、新一代测序技术开发者等提供存放和共享基因信息的云工具。FDA官员Kass-Hout将这一工具比作软件行业的常用平台GitHub,在这里软件工程师们可以编写并上传自己的软件,供他人学习使用,同时在这一网站上找到自己需要的程序。与之类似的,“精准FDA”平台将帮助基因测序开发者上传自己的研究成果,并与其他研究人员共享自己获得的基因组信息。其他研究团体可以通过“精准FDA”平台分享使用、重复和验证他人的研究成果,并最终对某种特定的研究进行可重复性验证。
 
  这一平台的诞生意味着FDA以一个较为统一的标准评估以DNA测序为基础的检测方法成为了可能。
 
  Kass-Hout同时强调,FDA并无意将“精准FDA”平台作为现有管理体系的一部分,而是要通过吸引众多基因检测方法开发者的方式将制定游戏规则的权利交给所有开发者。FDA设想,通过该平台共享基因数据后,来自世界各地的研究人员将可以更好地判断哪种测试方法是最有效的,而FDA也可以根据这一结果对未来诊断方法开发进行更高效的管理。
 
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